Situé dans la préfecture d'Ibaraki, à l'est du Japon, Agukaru suit Sanae Baraki, la fille d'un fermier capable de voir les esprits. Chaque jour, elle travaille dans son champ aux côtés de ces esprits pour produire les meilleurs produits agricoles. Cependant, un groupe convoite ce champ. Avec la bénédiction de la terre, elle se transforme en Ange de l'Agriculture, Baraki.