Après la chute définitive du rebelle Naga, la paix est revenue à Vestroia. Avec l'aide de Danma Kuusou, de son compagnon Dragonoïde Pyrus, et des autres Battle Brawlers, les Cœurs Infini et Silencieux ont été combinés, et le royaume recréé. Cependant, Vestroia la Nouvelle ne connaîtra aucun répit, car des envahisseurs extraterrestres humanoïdes, les Vestaux, arrivent et conquièrent le monde des B

Après la chute définitive du rebelle Naga, la paix est revenue à Vestroia. Avec l'aide de Danma Kuusou, de son compagnon Dragonoïde Pyrus, et des autres Battle Brawlers, les Cœurs Infini et Silencieux ont été combinés, et le royaume recréé. Cependant, Vestroia la Nouvelle ne connaîtra aucun répit, car des envahisseurs extraterrestres humanoïdes, les Vestaux, arrivent et conquièrent le monde des Bakugan d'un seul coup. Armés d'une terrible machine capable de restreindre les Bakugan à leurs formes de billes, ils visent à asservir cette race à des fins de divertissement. Désormais, la seule force qui s'oppose à eux est la Résistance des Battle Brawlers Bakugan—un groupe d'humains, de Bakugan et de Vestaux qui s'opposent à l'anéantissement d'une race consciente. Menés par Danma, ils doivent s'aventurer dans Vestroia la Nouvelle, occupée par l'ennemi, et repousser les envahisseurs, afin d'assurer la survie du monde entier.