Après avoir été percuté par un camion en 2014, Akira Natsume se réveille à l'intérieur d'une machine à l'issue d'un coma de 16 ans. Alors qu'il s'adapte à la nouvelle interface, il est accueilli par l'officier de police Minami Uezono et son partenaire androïde, Alma. Le duo révèle à Akira que son cerveau est contenu dans un appareil appelé EX-ARM, une arme de destruction massive. À bord d'un navir

Après avoir été percuté par un camion en 2014, Akira Natsume se réveille à l'intérieur d'une machine à l'issue d'un coma de 16 ans. Alors qu'il s'adapte à la nouvelle interface, il est accueilli par l'officier de police Minami Uezono et son partenaire androïde, Alma. Le duo révèle à Akira que son cerveau est contenu dans un appareil appelé EX-ARM, une arme de destruction massive. À bord d'un navire de contrebande ennemi, les trois doivent s'échapper en utilisant uniquement leur ingéniosité et leurs compétences de combat. Bien qu'initialement réticent à se battre, Akira se souvient bientôt des paroles de son frère avant l'accident. Ce souvenir l'inspire à agir, prenant possession du corps d'Alma pour combattre ses adversaires en utilisant les arts martiaux. Une fois qu'Alma le branche à l'un des ports du navire, il découvre le potentiel dévastateur de son EX-ARM en piratant sans effort le vaisseau et en en prenant le contrôle. Après être revenu sain et sauf sur terre, Akira rencontre les autres membres de l'EX-ARM Countermeasure Prevention Team, une division de police qui s'efforce d'atténuer les effets des EX-ARMs. Témoin des atrocités commises par ceux qui recherchent le pouvoir des EX-ARMs, il décide de rejoindre l'équipe et de mettre fin à la terreur causée par ces armes.