Un jour, une sculpture en pierre ressemblant étrangement à Keroro arrive chez Fuyumi. Pour résoudre ce mystère, l'escouade Keroro se rend sur l'île de Pâques, isolée et mystérieuse. Là, ils rencontrent des esprits inoffensifs connus sous le nom de Mana, ainsi que les étranges jumeaux Io et Rana. Enfin, il y a Akuaku, un esprit maléfique légendaire récemment réveillé de son long sommeil.