« Un cœur qui croit est ta magie ! » : telles furent les paroles que prononça autrefois Atsuko « Akko » Kagari, sa source d'inspiration, la célèbre sorcière Shiny Chariot, lors d'un spectacle de magie. Depuis, Akko vit selon ces mots et aspire à devenir une sorcière comme Shiny Chariot, capable de faire sourire les gens. Ainsi, même son absence d'antécédents magiques ne l'empêche pas de s'inscrire

« Un cœur qui croit est ta magie ! » : telles furent les paroles que prononça autrefois Atsuko « Akko » Kagari, sa source d'inspiration, la célèbre sorcière Shiny Chariot, lors d'un spectacle de magie. Depuis, Akko vit selon ces mots et aspire à devenir une sorcière comme Shiny Chariot, capable de faire sourire les gens. Ainsi, même son absence d'antécédents magiques ne l'empêche pas de s'inscrire à l'Académie Magique Luna Nova. Cependant, alors qu'une Akko excitée s'apprête enfin à rejoindre sa nouvelle école, le voyage s'avère tout sauf tranquille. Après son périple périlleux, elle se lie d'amitié avec la timide Lotte Yansson et la sarcastique Sucy Manbavaran. À sa plus grande joie, elle découvre également la baguette de Chariot, la Shiny Rod, qu'elle s'approprie. Malheureusement, son séjour à Luna Nova s'annonce plus difficile qu'Akko n'aurait jamais pu l'imaginer. Elle refuse catégoriquement de rester inférieure au reste de ses camarades, en particulier à sa rivale autoproclamée, la belle et talentueuse Diana Cavendish, elle compte donc sur sa détermination pour compenser son comportement imprudent et son inaptitude à la magie. À une époque où la sorcellerie est en déclin, Little Witch Academia suit les escapades magiques d'Akko et de ses amies alors qu'elles apprennent la véritable signification d'être une sorcière.