Satoshi et ses amis se retrouvent perdus dans un désert inconnu. Ils finissent par tomber sur un « Spectacle Pokémon d'Eau » donné par Hiromi, la star de la Troupe Marine. Descendante d'une troupe d'Humains Aquatiques capables de communiquer avec les Pokémon d'eau, Hiromi raconte à nos héros la légende transmise par son peuple depuis des générations. Selon cette légende, un temple construit par le

Satoshi et ses amis se retrouvent perdus dans un désert inconnu. Ils finissent par tomber sur un « Spectacle Pokémon d'Eau » donné par Hiromi, la star de la Troupe Marine. Descendante d'une troupe d'Humains Aquatiques capables de communiquer avec les Pokémon d'eau, Hiromi raconte à nos héros la légende transmise par son peuple depuis des générations. Selon cette légende, un temple construit par les Humains Aquatiques, nommé « Le Temple de l'Eau Akuusha », se trouverait quelque part dans l'océan, et y serait caché un trésor appelé « La Couronne d'Eau ». On dit que personne n'a jamais vu ce trésor, mais cela change lorsqu'un Ranger Pokémon nommé Jack Walker (alias Jackie) apparaît pour le traquer. Jackie est en mission secrète qui consiste à protéger l'œuf du chef des Pokémon d'eau, Manaphy. Ce Pokémon, surnommé le « Prince des Mers », doit être emmené au Temple de l'Eau Akuusha, alors Satoshi et ses amis décident de l'aider. En chemin, un pirate nommé Phantom attaque nos héros depuis son grand sous-marin. Phantom prévoit d'utiliser le pouvoir de la Couronne d'Eau pour conquérir le monde, mais il devra d'abord résoudre le mystère de l'œuf de Manaphy. Lorsque la Rocket-Dan s'en mêle, Jackie utilise son Style Capture pour emprunter le pouvoir d'un Pokémon proche afin de leur faire face. Satoshi et Pikachu entrent dans la mêlée, mais ils doivent encore faire face aux attaques du puissant mecha high-tech de Phantom ! Soudain, l'œuf se met à briller d'une lumière vive, et Manaphy naît ! Quel est le mystère du trésor légendaire ? Quels pouvoirs mystérieux Manaphy possède-t-il ? Satoshi et Jackie réussiront-ils à accomplir leur mission secrète ? Le voyage pour atteindre le Temple de l'Eau Akuusha a commencé !