Yumi Ikoma et Ryou Masaoka sont deux enfants sélectionnés pour participer à une mission top secrète : piloter les premières unités de combat Fafner, dernier espoir de survie de l'espèce humaine. Leur ennemi est impitoyable, sans remords et capable de lire dans les pensées humaines. Par conséquent, les détails de cette mission sont gardés secrets, même des personnes qui y sont impliquées. Les jeune

Yumi Ikoma et Ryou Masaoka sont deux enfants sélectionnés pour participer à une mission top secrète : piloter les premières unités de combat Fafner, dernier espoir de survie de l'espèce humaine. Leur ennemi est impitoyable, sans remords et capable de lire dans les pensées humaines. Par conséquent, les détails de cette mission sont gardés secrets, même des personnes qui y sont impliquées. Les jeunes pilotes devront faire appel à tout leur courage et leur foi pour survivre et accomplir leur mission, sous peine de compromettre le destin de l'humanité.