Trois ans après le retour du légendaire Vaisseau Spatial Yamato, la Terre a entamé sa reconstruction et a fait la paix avec les Gamilans. Cependant, cette reprise se fait au prix de l'utilisation de la technologie interdite de l'Onde de Choc. Pendant ce temps, les anciens membres d'équipage notoires du Yamato, qui ont chacun pris des chemins différents, reçoivent un message psychique de la mystér

Trois ans après le retour du légendaire Vaisseau Spatial Yamato, la Terre a entamé sa reconstruction et a fait la paix avec les Gamilans. Cependant, cette reprise se fait au prix de l'utilisation de la technologie interdite de l'Onde de Choc. Pendant ce temps, les anciens membres d'équipage notoires du Yamato, qui ont chacun pris des chemins différents, reçoivent un message psychique de la mystérieuse Déesse Teresa. Elle les exhorte à retourner sur leur cher vaisseau et à voyager vers la lointaine planète Terezart. Il leur est promis un pouvoir révolutionnaire pour combattre la menace sans précédent de l'implacable Empire Gatlantis, qui approche de la Terre avec des intentions tout sauf innocentes. Incapables de résister à son appel, l'équipage se rassemble et embarque pour un autre périlleux voyage intergalactique, qui mettra à l'épreuve leur pur courage et leur polyvalence face à un ennemi encore plus grand.