Depuis bien longtemps, les humains polluent les océans, déversant négligemment leurs déchets et profanant les eaux qui servent de foyer à d'innombrables créatures. Les habitants des mers ont souffert des mains empoisonneuses de l'homme. Finalement, une certaine créature des profondeurs en a assez et jure de punir les actions égoïstes de l'humanité. Possédant tous les redoutables pouvoirs d'un cal

Depuis bien longtemps, les humains polluent les océans, déversant négligemment leurs déchets et profanant les eaux qui servent de foyer à d'innombrables créatures. Les habitants des mers ont souffert des mains empoisonneuses de l'homme. Finalement, une certaine créature des profondeurs en a assez et jure de punir les actions égoïstes de l'humanité. Possédant tous les redoutables pouvoirs d'un calmar, tels que de puissants tentacules capillaires, la capacité de cracher de l'encre et même d'utiliser la bioluminescence à volonté, Ika Musume s'est donné pour mission de remonter des profondeurs de l'océan pour se venger de l'humanité ! Elle fait surface à la Lemon Beach House, un restaurant géré par les sœurs Eiko et Chizuru Aizawa. Les considérant comme une première étape facile vers la domination mondiale, elle leur déclare immédiatement la guerre, pour découvrir qu'elle est, littéralement, un poisson hors de l'eau ! Pour couronner le tout, elle détruit une partie du mur de la maison de plage dans une tentative d'afficher sa supériorité de calmar et se retrouve par conséquent forcée de devenir serveuse pour payer les réparations. Échouée pour le moment après avoir goûté à une sévère défaite face aux sœurs Aizawa, Ika Musume est obligée de mettre ses plans de domination mondiale en attente. Malgré ces revers, Ika Musume se retrouve bientôt à l'aise dans sa nouvelle position inattendue d'employée de la Lemon Beach House. Drôle et loufoque, Shinryaku! Ika Musume suit sa toute nouvelle vie à la surface, créant des souvenirs précieux et rencontrant plein de nouvelles personnes. Avec ses nouvelles connaissances, Ika Musume compte bien conquérir le monde, une assiette de spaghettis à l'encre de calmar à la fois !