Alors qu'il roule avec Jack Atlas et Crow Hogan, le Dragon de Poussière d'Étoile de Yuusei Fudou est capturé par Paradox, un mystérieux Turbo Duelliste venu du futur, lors d'un Turbo Duel et transformé en Monstre Péché. Avec l'aide du Dragon Cramoisi, Yuusei poursuit Paradox qui entre dans un glissement temporel, se retrouvant dans le passé. Durant ce laps de temps, Paradox affronte Jaden Yuki, qu

Alors qu'il roule avec Jack Atlas et Crow Hogan, le Dragon de Poussière d'Étoile de Yuusei Fudou est capturé par Paradox, un mystérieux Turbo Duelliste venu du futur, lors d'un Turbo Duel et transformé en Monstre Péché. Avec l'aide du Dragon Cramoisi, Yuusei poursuit Paradox qui entre dans un glissement temporel, se retrouvant dans le passé. Durant ce laps de temps, Paradox affronte Jaden Yuki, qui peut encore utiliser les pouvoirs de Yubel et du Roi Suprême. Cependant, Paradox a également capturé le Dragon Cyber-Fin et le Dragon Arc-en-ciel et submerge Jaden. Ce dernier est sauvé grâce à Yuusei et au Dragon Cramoisi. Jaden informe Yuusei des véritables intentions de Paradox. En volant divers monstres à travers le temps et en les corrompant, il prévoit de tuer Maximillion Pegasus, le créateur des Monstres de Duel, empêchant ainsi la création du jeu et provoquant la non-réalisation des événements des trois séries. Yuusei et Jaden acceptent de poursuivre Paradox, ce qui les mène dans le passé et provoque une rencontre avec le Roi des Jeux, Yuugi Mutou. Cependant, au moment où Yuusei et Jaden arrivent, Paradox a déjà attaqué son époque, tuant apparemment à la fois Pegasus et le grand-père de Yuugi, et a également réussi à voler le Dragon Blanc aux Yeux Bleus et le Dragon Noir aux Yeux Rouges. Après avoir tout expliqué à Yuugi, ce dernier accepte de combattre aux côtés de Yuusei et Jaden contre Paradox dans le duel ultime à trois contre un pour libérer les monstres piégés et sauver le monde ainsi que le temps lui-même avant qu'il ne soit trop tard.