La planète Zi a été dévastée par des catastrophes naturelles, anéantissant presque toute vie. Mille ans plus tard, les humains ont progressivement rétabli la civilisation, récupérant d'anciens Zoids grâce à des efforts de plongée et d'exploitation minière. Dans un village dont l'objet le plus précieux est une épée géante qu'ils vénèrent comme un symbole sacré. Un adolescent découvre un ancien Zoid

La planète Zi a été dévastée par des catastrophes naturelles, anéantissant presque toute vie. Mille ans plus tard, les humains ont progressivement rétabli la civilisation, récupérant d'anciens Zoids grâce à des efforts de plongée et d'exploitation minière. Dans un village dont l'objet le plus précieux est une épée géante qu'ils vénèrent comme un symbole sacré. Un adolescent découvre un ancien Zoid de type Liger lors d'une opération de récupération en eaux profondes. Soudain, le village est attaqué par des Bio-Zoids squelettiques dont l'intention est de voler un puissant générateur situé dans le village. Notre jeune héros réveille le Liger et découvre que l'épée sacrée de la ville est l'arme du Liger ; ensemble, ils repoussent les mystérieux Bio-Zoids. Du moins, pour l'instant...