Une année peut changer une vie à jamais. Les 365 jours que la classe 3-E du collège Kunugigaoka a passés avec leur professeur excentrique, Koro-sensei, l'ont certainement fait. Gardant les souvenirs de cette année précieusement en eux, les anciens élèves Nagisa Shiota et Karma Akabane retournent dans leur ancienne salle de classe pour se remémorer les événements de cette période marquante de leur

Une année peut changer une vie à jamais. Les 365 jours que la classe 3-E du collège Kunugigaoka a passés avec leur professeur excentrique, Koro-sensei, l'ont certainement fait. Gardant les souvenirs de cette année précieusement en eux, les anciens élèves Nagisa Shiota et Karma Akabane retournent dans leur ancienne salle de classe pour se remémorer les événements de cette période marquante de leur vie. Nagisa et Karma se remémorent, grâce aux pièces familières, aux bureaux, au tableau noir et à l'album de la classe, les événements qui ont fait d'eux des « assassins » et les ont préparés au monde réel. Tel est l'héritage de leur enseignant semblable à une pieuvre – qui s'était présenté en menaçant de détruire le monde s'ils ne le tuaient pas avant la fin de l'année scolaire – et du temps passé dans la « Classe des Tueurs », à la fois étrange et exceptionnelle.