La deuxième série suit les événements du deuxième jeu vidéo et se concentre sur le continent perdu de Mu. Cette ancienne civilisation a disparu il y a des siècles, et quelques-uns de ses vestiges subsistent sous forme de mythes et légendes appelés UMAs (formes de vie non identifiées). Les UMAs commencent à fusionner avec des humains afin de rechercher les trésors de Mu, les puissants ooparts, qui

La deuxième série suit les événements du deuxième jeu vidéo et se concentre sur le continent perdu de Mu. Cette ancienne civilisation a disparu il y a des siècles, et quelques-uns de ses vestiges subsistent sous forme de mythes et légendes appelés UMAs (formes de vie non identifiées). Les UMAs commencent à fusionner avec des humains afin de rechercher les trésors de Mu, les puissants ooparts, qui leur donneront le pouvoir de faire revivre Mu. Après que Subaru et War-Rock aient rencontré plusieurs ennemis inhabituels, ils font la connaissance d'un professeur nommé Docteur Orihime, qui les envoie en quête pour retrouver les ooparts et arrêter les UMAs. En utilisant les ooparts, Rockman est capable de prendre de nouvelles formes, dont Thunder Berserk, Fire Dinosaur et Green Shinobi.